Diverse hypotheses have been proposed to explain artificial cranial modification (ACM) in South America. In the Atacama area (Northern Chile), some studies have concluded that it was used to create a communal identity that could serve to resist, or to form alliances with, different external groups (Inter Site Distinction hypothesis, this work). On the other hand, other studies have suggested that there was a relationship between ACM and the social status and gender of the individuals within the community (Intra Site Distinction hypothesis, this work). These studies, however, have relied mainly on typological methods and the archaeological contexts to which these modification categories are associated have been simplified as well. In this work we use a quantitative multivariate approach to assess the relationship between cranial morphology and funerary context. The modification patterns of populations inhabiting Northern Chile during the Formative (3500-1600 B.P) and Late Intermediate (950-500 B.P.) periods were studied. We analyzed the X-rays of 203 individuals belonging to 7 archaeological sites and, when possible, they were correlated with the corresponding funerary context. The results indicate that cranial morphology correlates with the interaction networks among sites, therefore these results support the Inter Site hypothesis.Diversas explicaciones han sido propuestas para explicar la modificación intencional del cráneo (ACM) en Sudamérica. En Atacama, algunos estudios han concluido que fue utilizada para crear una identidad común que sirvió para resistir o formar alianzas con distintos grupos foráneos (aquí, Hipótesis de Distinción Inter-Sitio). Otros han sugerido que estaba relacionada con el estatus social y/o el sexo de los individuos dentro de la comunidad (aquí, Hipótesis de Distinción Intra-Sitio). Sin embargo, los métodos usados para llegar a estas conclusiones tienen limitaciones significativas porque han usado principalmente métodos tipológicos y los contextos arqueológicos a los que han sido asociados estas categorías de ACM han sido simplificados. Aquí usamos un enfoque multivariado y cuantitativo para evaluar la relación entre la morfología craneal y el contexto funerario. Se analizó la ACM de las poblaciones que habitaron el Norte de Chile durante el Periodo Formativo (3500-1600 B.P) y el Periodo Intermedio Tardío (950-500 B.P.). Se analizaron los rayos X de 203 individuos pertenecientes de 7 sitios arqueológicos y, cuando fue posible, estos fueron correlacionados con su contexto funerario. Los resultados indican que la morfología craneal se correlaciona con las redes de intercambio entre los sitios. Estos resultados apoyan la Hipótesis de Distinción Intra-Sitio.