Aim: The objective of this research was to analyze, by gender, the association between health-risk behaviors and academic achievement (AA) in first year university Chilean students. Method: After informed consent was obtained, an analytical cross-sectional study was performed, which included 717 first-year university students aged 17-19 years. Youth Risk Behavior Survey was used to evaluate self reported health-risk behaviors. The high school grade point average was used to evaluate AA. Results: The results of multiple linear regression models showed associations between low AA and health-risk behaviors including substance use, physical inactivity, violence, unprotected sexual activity, and risk of suicide. Differences by gender were observed across these associations. Conclusions: This study supports the hypothesis of an association in men and women between health-risk behaviors with lower AA between women and men.Objetivo: Analizar por sexo, la asociación entre comportamientos de riesgo para la salud y rendimiento académico en estudiantes universitarios chilenos de primer año. Método: Estudio transversal realizado en 717 estudiantes con edades entre 17 y 19 años. Para valorar el autoreporte de los comportamientos de riesgo para la salud, se utilizó el Youth Risk Behavior Survey. Para evaluar rendimiento académico se utilizó el promedio final de calificaciones de la educación media. Se obtuvieron consentimientos informados. Resultados: Los modelos de Regresión Lineal Múltiple, mostraron asociaciones entre bajo rendimiento académico y comportamientos de riesgo para la salud incluyendo uso de sustancias, inactividad física, violencia, actividad sexual no protegida y riesgo de suicidio. Se observaron diferencias por género en las asociaciones mencionadas. Conclusiones: Este estudio apoya la hipótesis de asociación entre comportamientos de riesgo para la salud y rendimiento académico, tanto en hombres como en mujeres.