Los problemas de resistencia de Streptoco-ccus pyogenes son relativos a la adquisición de resistencia a macrólidos lo cual ocurre mediante dos mecanismos: modificación del sitio de acción en el ribosoma, resistencia tipo MLS B codificada por el gen erm que se asocia con resistencia a lincosamidas y streptogramina B, y por eflujo activo codificado por gen mef con resistencia sólo a macrólidos, siendo éste el mecanismo más frecuentemente encontrado en este microorganismo. En Chile se han aislado cepas de Streptoco-ccus pyogenes resistentes a macrólidos desde 1994, con porcentaje de resistencia promedio en los últimos seis años de 7% en el área Metropolitana