RESUMEN El estero Nonguén (orden 3), tributario de la zona inferior del río Andalién (región del Bío-Bío), presenta una marcada diferencia entre su parte alta ritral, bien conservada y con un bosque secundario de Nothofagus, y su parte baja potamal, de uso urbano y de aguas con contaminación orgánica. Este contraste podría implicar la alteración de los patrones normales detectados en la ictiofauna chilena descritos para diversos sistemas fluviales. Tales patrones consisten en un aumento del número de especies, individuos y diversidad en el sentido de la corriente, así como en un incremento de las tallas corporales de los individuos que habitan las zonas bajas. Se estudió la composición específica de peces del estero Nonguén y sus patrones comunitarios a lo largo del sistema fluvial en un ciclo anual. Se encontró un incremento en la riqueza específica, desde cuatro especies en el ritrón a diez en el sector de desembocadura. Tanto la diversidad, abundancia y distribución de los peces varió según la época del año, reflejando los desplazamientos asociados a la ontogenia, reproducción y alimentación de la fauna íctica. Las estaciones de la zona media y baja del estero presentaron un ensamble con individuos de menor tamaño que los que se encuentran en la cabecera, consistentemente con la dominancia de salmónidos de mayor talla en la parte alta. Los resultados sugieren que: (i) la alteración del área potamal no modifica significativamente los patrones característicos de la ictiofauna de sistemas fluviales, y que (ii) el estero Nonguén es un sistema de reproducción y crianza de juveniles de especies nativas e introducidas, las cuales conforman asociaciones permanentes en este sistema fluvial.