En este artículo se propone un modelo dinámico de un proceso de tratamiento de aguas residuales por digestión anaerobia. Este modelo está descrito por un conjunto de ecuaciones diferenciales ordinarias, que predicen el comportamiento dinámico de las especies principales en este sistema. A diferencia de otros modelos, el que aquí se propone es capaz de cuantificar la concentración del ácido propiónico en el medio. El modelo incluye el equilibrio electroquímico en la fase líquida así como las restricciones termodinámicas inducidas por la presión parcial de hidrógeno. El modelo es probado mediante simulación numérica y muestra como se acumula el ácido propiónico debido a la inhibición en la fase metanogénica causada por una aumento en la presión parcial del hidrógeno