Berberís empetrifolia Lam. ha sido parcialmente estudiada en cuanto a su contenido de alcaloides cuaternarios. Al reestudiar la corteza y madera de tallos subterráneos de esta planta fue posible aislar un alcaloide dimérico, la paquistanina, y el lignano siringarresinol. Este lignano parece ser un componente común a varias especies chilenas de Berberís; la paquistanina, por el contrario, es una base del tipo aporfinabencilisoquinolina que hasta ahora sólo habia sido encontrada en especies asiáticas del género.