Show simple item record

THE cpDNA trnL-trnF CONTRIBUTES TO THE SEPARATION OF THE SUBGENERA Persea and Eriodaphne (Lauraceae; Persea) AS INDEPENDENT GENERA

EL trnL-trnF DE cpADN CONTRIBUYE A LA SEPARACIÓN DE LOS SUBGÉNEROS Persea y Eriodaphne (Lauraceae; Persea) COMO GÉNEROS INDEPENDIENTES

dc.creatorCabrera-Hernández, Cecilia
dc.creatorValadez-Moctezuma, Ernestina
dc.creatorCruz-Maya, María Edith
dc.creatorZelaya-Molina, Lily X.
dc.creatorBarrientos-Priego, Alejandro F.
dc.creatorReyes-Alemán, Juan Carlos
dc.date2018-01-10
dc.date.accessioned2020-07-10T03:18:55Z
dc.date.available2020-07-10T03:18:55Z
dc.identifierhttps://revistas.udec.cl/index.php/chjaas/article/view/481
dc.identifier.urihttps://revistaschilenas.uchile.cl/handle/2250/139809
dc.descriptionThe genus Persea has two subgenera, Persea and Eriodaphne. There is controversy about the taxonomy between species of the subgenus Persea, and its relationships with the subgenus Eriodaphne. Because of its complex evolutionary patterns, the subgenus Persea has considerable variability with uncertain taxonomic affinities. In this study, we analyzed the sequences of the trnLtrnF region of chloroplast DNA from leaves of 38 accessions: 7 of the subgenus Eriodaphne and 31 from the subgenus Persea; one accession of the subgenus Beilschmiedia was also included. The first alignment with the trnL-trnF intergenic spacer included 12 individuals of the genus Persea and one of Beilschmiedia, which were aligned with 26 sequences from the GenBank of 22 genera of the Lauraceae family and one of the Hernandiaceae family. In a second alignment with a fragment close to 900 pb that comprises the end 3’ of the trnLuaa gene, which includes an intron, the trnL-F spacer and the end 5’ of the trnFgaa gene, four sequences from the GenBank were included: one of Perseaamericana (AY841669), and three species of the genus Sassafras. The aim of this study was to infer the possible phylogenetic relationships, particularly those of the two subgenera. The phylogenetic analysis was not consistent with the current classification of the genus as it clearly separated the two subgenera Persea and Eriodaphne, while in the clade of subgenus Persea did not show species grouping or affinity. The findings of this study support the hypothesis that the subgenera Persea and Eriodaphne should be regarded as independent genera.en-US
dc.descriptionEl género Persea tiene dos subgéneros, Persea y Eriodaphne. Existe controversia sobre la taxonomía entre las especies del subgénero Persea y su relación con el subgénero Eriodaphne. Debido a sus complejos patrones evolutivos, el subgénero Persea tiene considerable variabilidad con afinidades taxonómicas inciertas. En este estudio se analizaron las secuencias de la región trnL-trnF de DNA de cloroplastos, obtenidos de hojas de 38 accesiones, siete del subgénero Eriodaphne y 31 del subgénero Persea, además uno de Beilschmiedia. Un primer alineamiento con el espacio intergénico trnL-trnF, incluyó 12 individuos del género Persea y uno del género Beilschmiedia, que se alinearon con 26 secuencias del GenBank de 22 géneros de la familia Lauraceae y un género de la familia Hernandiaceae. En un segundo alineamiento con un fragmento de aproximadamente 900 pb que comprende el extremo 3’ del gen trnLuaa que incluye un intron, el espaciador trnL-F y el extremo 5’ del gel trnFgaa; se incluyó cuatro secuencias del GenBank, una de Persea americana (AY841669), y tres especies del género Sassafras. Lo anterior con el objetivo de inferir sus posibles relaciones filogenéticas y en especial la de los dos subgéneros. El análisis filogenético no fue congruente con la clasificación actual del género, donde se separó fuertemente los dos subgéneros Persea y Eriodaphne, mientras que el clado del subgénero Persea no mostró una agrupación por raza, al igual que por afinidad de especies. Lo encontrado soporta la hipótesis de que los subgéneros Persea y Eriodaphne deben considerarse como géneros independientes.es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherFacultad de Agronomía, Facultad de Ingeniería Agrícola y Facultad de Ciencias Veterinarias - Universidad de Concepciónes-ES
dc.relationhttps://revistas.udec.cl/index.php/chjaas/article/view/481/956
dc.relationhttps://revistas.udec.cl/index.php/chjaas/article/view/481/957
dc.sourceChilean Journal of Agricultural & Animal Sciences (ex Agro-Ciencia); Vol. 33 No. 3 (2017); 231-240en-US
dc.sourceChilean Journal of Agricultural & Animal Sciences (ex Agro-Ciencia); Vol. 33 Núm. 3 (2017); 231-240es-ES
dc.source0719-3890
dc.source0719-3882
dc.subjectavocadoen-US
dc.subjectaguacatilloen-US
dc.subjectPerseaen-US
dc.subjectEriodaphneen-US
dc.subjecttaxonomic classificationen-US
dc.subjectphylogenyen-US
dc.subjectintergenic spaceren-US
dc.subjectaguacatees-ES
dc.subjectaguacatilloes-ES
dc.subjectPerseaes-ES
dc.subjectEriodaphnees-ES
dc.subjectclasificación taxonómicaes-ES
dc.subjectfilogeniaes-ES
dc.subjectespacio intergénicoes-ES
dc.titleTHE cpDNA trnL-trnF CONTRIBUTES TO THE SEPARATION OF THE SUBGENERA Persea and Eriodaphne (Lauraceae; Persea) AS INDEPENDENT GENERAen-US
dc.titleEL trnL-trnF DE cpADN CONTRIBUYE A LA SEPARACIÓN DE LOS SUBGÉNEROS Persea y Eriodaphne (Lauraceae; Persea) COMO GÉNEROS INDEPENDIENTESes-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion


This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record