Background: Nosocomial fungal infections have significantly increased over the past 2 decades. Candida species are recognized as leading nosocomial pathogens in neonatal intensive care unit. Objective: To describe the clinical and microbiological profile of Candida infections in a neonatal intensive care unit. Method: Retrospective case-control study in a period of 10 years (1994-2004), performed in all newborns admitted to our unit. Each case was compared with 2 control neonates who did not have fungal infection. Results: 14 cases of Candida infections were identified. Compared with match controls (n = 28), newborns with Candida infections had significantly (p < 0,05) longer hospitalizations and duration of mechanical ventilation, use of parenteral nutrition and broad spectrum antibiotics, along with surgical interventions and mortality. In the group with fungal infections, 9 were term or near-term newborns, mean age at onset was 21 days and Candida albicans was recovered from 8 of 14 cases. Blood was the main source for positive cultures (8/14), fungal dissemination was rare and 28% died (4/14). Conclusions: Candida infections predominate in term and near-term newborns and Candida no albicans have become common agents of nosocomial fungal infections in our unit. Improvement of diagnosis and multiple organ evaluation are further required.Introducción: La infecciones nosocomiales por hongos han aumentado significativamente en los últimos veinte años, y entre estas, las infecciones por Candida constituyen una causa emergente en unidades de neonatología. Objetivos: Caracterizar el perfil clínico-microbiológico de los recién nacidos ingresados a una unidad de neonatología que desarrollaron una infección por Candida. Pacientes y Método: Estudio retrospectivo tipo caso control en un período de 10 años (1994 a 2004). Por cada caso se seleccionaron dos controles de similar edad gestacional que no hayan presentado infección a Candida. Resultados: Se identificaron 14 casos con infecciones por Candida. Comparados con los controles (n = 28) los recién nacidos con infecciones por Candida tuvieron significativamente (p < 0,05) mayor: estadía hospitalaria, proporción de ventilación mecánica, uso de alimentación parenteral - antibióticos, intervenciones quirúrgicas y mortalidad. En el grupo con infecciones por Candida; nueve se presentaron en recién nacidos a término o cerca del término, la especie más frecuentemente aislada fue Candida albicans en ocho casos y en seis casos Candida no albicans siendo el principal sitio de aislamiento el territorio sanguíneo. La mortalidad en esta serie fue de 28% (4/14). Conclusiones: En nuestra unidad, las Infecciones por Candida predominaron en recién nacidos a término y se confirma la emergencia de Candida no albicans como causantes de infecciones nosocomiales por hongos. Se requiere optimalizar el diagnóstico precoz y la búsqueda de la diseminación a distancia de estas infecciones.