Background: Fragile X syndrome (FXS) is the most prevalent cause of inherited mental retardation in males, with an incidence of 1/4 000 males and 1/8 000 females. 3 molecular alterations have been identified: permutation, full mutation and mosaics, where expanded CGG repeats in the 5´ region surrounding FMR1 gene promoter. Individuals with permutation present between 52 and 200 repeats, whereas full mutations with more than 200 repeats show impaired gene transcription by hypermethylation of FMR1 gene promoter region and absence of FMRP protein, producing mental retardation and specific FXS clinical characteristics.Objective: The FXS clinical diagnosis is performed using a protocol that considers 15 characteristics; however, the phenotypical differences difficult the exact identification.Method: 99 male patients referred to INTA with mental retardation and clinical characteristics suggesting FXS were evaluated.Results: 23 cases present FMR1 full mutation with clinical score 16 to 27 points and 76 cases without mutation with clinical score 10 to 26 points. Comparing both groups, 4 clinical characteristics were significantly different and 3 of them were frequently associated with full mutation, independent of age.Conclusions: In order to optimize the molecular study of FMR1 gene, the selection of patients should include a clinical screening, so that the study is performed in individuals with clinical score ³ 15 points.Introducción: El síndrome de X frágil (SXF) es una causa frecuente de retraso mental (RM), se presenta en 1 de 4 000 hombres y en 1 de 8 000 mujeres. A nivel molecular existen principalmente tres tipos de alteraciones: premutación, mutación completa y mosaicos, todas las cuales corresponden a amplificación del trinucleótido CGG localizado en el primer exón del gen FMR1: las premutaciones presentan entre 52 y 200 repetidos; las mutaciones completas, sobre 200 CGG, presentan hipermetilación de la región promotora del gen FMR1 e inhibición de la expresión de la proteína FMRP, causante del RM y dismorfias características de este síndrome. Los mosaicos presentan mutación completa y premutación o metilación parcial del gen FMR1. Los pacientes con SXF son diagnosticados clínicamente según un protocolo de tamizaje que considera 15 características clínicas que entrega un puntaje máximo de 30 puntos en individuos afectados. Objetivo: Definir criterios clínicos específicos para población chilena que ayuden a identificar a los individuos que deban ser sometidos a estudios moleculares confirmatorios de SXF. Pacientes y Método: Se consideraron 99 pacientes varones referidos al INTA por presentar retraso mental y características clínicas sugerentes del SXF; a todos se les realizó evaluación clínica utilizando el protocolo descrito por Buttler y estudio molecular con análisis directo del gen FMR1 por Southern blot. Resultados: 23 de los 99 pacientes estudiados presentaron una mutación en FMR1 y puntaje clínico entre 16 y 27 puntos; los 76 casos restantes con puntajes clínicos entre 10 y 26 puntos, no presentaron mutación en el gen FMR1. Se evaluaron las características clínicas en ambos grupos y se observó que 4 de ellas se asocian significativamente a la mutación, siendo tres de ellas independientes de la edad de los pacientes. Conclusiones: Con estos resultados y a fin de optimizar el estudio molecular directo del gen FMR1, proponemos que el criterio de selección de pacientes sea a través del examen clínico y que todo individuo con puntaje ³ 15 puntos debe ser sometido al estudio molecular.