The replacement of natural areas by urban areas promotes changes in the composition of tree communities, frequently favoring the occurrence of exotic species. This may have direct implications in the structure of pathogenic fungal communities which grow in these hosts. Here we examine: a) the structure of the interaction networks between urban tree species and their pathogenic wood-decay fungi, b) the composition of pathogenic fungi in native and exotic hosts. The interactions network shows a nested pattern where several species of pathogenic fungi establish multiple interactions with various tree species, both native and exotic; while others establish more specific interactions. Richness of pathogenic fungi was higher in exotic trees than in natives. Thirteen fungal species occurred exclusively in exotic hosts, one in natives and the remaining nine species shared both exotic and native hosts.El reemplazo de áreas naturales por zonas urbanizadas afecta la composición de las comunidades arbóreas, generalmente favoreciendo la ocurrencia de especies vegetales exóticas. Esto tendría implicancias directas en la estructuración de las comunidades de hongos patógenos que hospedan estas especies arbóreas. En este trabajo se propuso examinar: a) la estructura de la red de interacciones entre especies del arbolado urbano y los hongos patógenos degradadores de la madera, b) la composición de hongos patógenos en especies nativas y exóticas. Se observó que la red de interacciones mostró un patrón de anidamiento en donde varias especies de hongos patógenos establecen múltiples interacciones con diversas especies arbóreas, tanto nativas como exóticas, mientras que otras establecieron interacciones más específicas. Se observó mayor riqueza de hongos en árboles exóticos en comparación a sus pares nativos. Trece de las especies fúngicas se registraron exclusivamente en árboles exóticos, una exclusivamente en sustrato nativo y las nueve restantes compartieron tanto árboles exóticos como nativos.