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Accelerated forest genetic breeding using genomic selection

Mejoramiento genético forestal acelerado mediante selección genómica

Author
Zapata-Valenzuela, Jaime

Hasbun Zaror, Rodrigo

Full text
http://revistas.uach.cl/index.php/bosque/article/view/449
10.4067/S0717-92002011000300001
Abstract
Chilean forest industry should not pursue development without incorporating advances from current biotechnology and genomics tools. Traditional forest breeding programs have been founded in phenotypic selection based on field testing which is time consuming, and where the prediction of breeding values is subjected to the influence of the environment. The use of marker-assisted selection has been focused on discovering quantitative trait loci using markers related to the expression of commercial traits, although a small fraction of explained genetic variance is usually achieved. In animal breeding, a recent revolutionary technology called genomic selection, defined as the use of dense single nucleotide polymorphism markers to predict genomic breeding values, has allowed taking advantage of all possible marker information in estimating genomic values which are highly correlated with true breeding values. The main aspects of this technology and its potential implications in forest breeding are discussed. While main factors that are controlling the performance of genomic selection should be carefully defined, such as the linkage disequilibrium level, trait heritability and the analytical procedures of estimation and validation of genomic values, it is expected that incorporation of genomic selection in forest breeding programs would allow the early capture of the best genotypes for propagation, selection and deployment in breeding of commercial forest traits.
 
La industria silvícola chilena no debiera desarrollarse al margen de las nuevas herramientas biotecnológicas. Los actuales programas de mejoramiento genético forestal se han sustentado en la selección de progenitores basándose en ensayos de progenie evaluados a largo plazo, en que la estimación de los valores genéticos está afectada por el ambiente. La selección asistida por marcadores moleculares ha facilitado detectar regiones genómicas cuantitativas asociadas a características productivas, aunque explica solo una pequeña proporción de la variación genética. En mejoramiento animal, la incorporación de marcadores de alta resolución en la predicción de valores genómicos, estrategia denominada selección genómica, ha permitido utilizar simultánea y eficientemente la información de miles de marcadores ahorrando tiempo en evaluación y selección. En este trabajo se revisan los principales aspectos de la selección genómica con el objeto de evaluar sus posibles implicancias en el mejoramiento genético forestal. La aplicación de esta estrategia requiere desarrollar un gran número de marcadores para capturar gran parte de la variación genética y definir los factores involucrados en los análisis, tales como el nivel de desequilibrio de ligamiento de la población, la heredabilidad de la característica, los métodos estadísticos y de validación de las predicciones. Se concluye que la implementación de selección genómica permitiría la captura temprana de los mejores individuos, obtener una mayor ganancia genética anual y permitir la plantación operacional del mejor material genético en forma más eficiente y productiva.
 
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