Structural attributes at different levels of biological organization (species, communities, landscape) and plant biodiversity are described and compared between the basins of Baker and Pascua Rivers in Aisen Region. Four hundred and ninety four vegetation samples were taken in forest ecosystems, bush, pasture, and peat to build tables of plant communities that differentiate and characterize biodiversity. The Shannon index, frequency and phytogeographical origin of species were used. Two hundred and ninety six species distributed in 30 communities, with high diversity of plant landscapes were found. Two hundred and forty three (82 %) of these species are native, and 53 (18 %), exotic, showing high human impact. Bushes are diverse formations, with 12 communities in the Baker basin. Anthropogenic grasslands exist only in the Baker basin. The community with the highest level of species richness was the thicket of Nothofagus antarctica with 109 species, whereas the krummholz of Nothofagus pumilio presented only seven species in the Baker basin. The Shannon index shows that the Magellanic forest (Pascua basin) is the most diverse community (H' = 2.923), whereas the Nothofagus pumilio krummholz is the least diverse one (H' = 0.615). The Baker basin has a higher wealth of native and exotic species and a higher variety of plant, than hose found at the Pascua basin probably due to the intense human intervention in the former.Se describen y comparan atributos estructurales en distintos niveles de organización biológica (especies, comunidades, paisaje), de la biodiversidad vegetal en las cuencas de los ríos Baker y Pascua en la región de Aisén. Se levantaron 494 censos de vegetación en ecosistemas boscosos, arbustivos, pratenses, turbosos y esteparios para construir tablas que diferenciaran comunidades vegetales y sirvieran para caracterizar la biodiversidad. Se utilizaron la riqueza específica, índice de Shannon, frecuencia y origen fitogeográfico de las especies. Se encontraron 296 especies distribuidas en 30 comunidades, con gran diversidad del paisaje vegetal. 243 (82 %) de estas especies son nativas, mientras que 53 (18 %), exóticas, evidenciando alta antropización. Los matorrales son formaciones variadas, con 12 comunidades de la cuenca del Baker. Praderas de origen antrópico solo existen en la cuenca del Baker. La mayor riqueza específica fue la del matorral de Nothofagus antarctica con 109 especies, en tanto que el Krummholz de Nothofagus pumilio, solo presentó siete especies en ambas cuencas. El índice de Shannon muestra que la comunidad más diversa es el bosque magallánico perennifolio (cuenca Pascua) (H' = 2,923), mientras que el Krummholz de N. pumilio es la comunidad de menor diversidad (H' = 0,615). La cuenca del Baker presenta mayor riqueza de especies nativas y exóticas y mayor variedad de comunidades vegetales que la cuenca del Pascua, seguramente por intensa intervención antrópica en la primera.