In the present study, the taxonomic status of Microlophus heterolepis and M. yanezi is reviewed. Although M. heterolepis is one of the identifi ed species present in Chile, incongruity about their geographical distribution, habitat and ecological characteristics are evident, so its true determination is an issue. Type materials and original descriptions of M. heterolepis were compared with its closest species M. yanezi, and morphological (scaling, lineal morphometric and geometric morphometric) and molecular analysis (cytb) were performed. The results show that: 1) M. heterolepis was originally described for the locality of Tacna in Peru, 2) morphological descriptions by Donoso-Barros (1966) correspond to a lizard in the desert, but their ecological characteristics were described erroneously as a kind of rocky intertidal, and 3) there is agreement with previous authors that both species are valid. However, based on our results, the geographical distribution of M. heterolepis is restricted to Peru, while M. yanezi is a validly described species from Chile.En el presente estudio se revisa el estatus taxonómico de Microlophus heterolepis y M. yanezi. A pesar que M. heterolepis es una de las especies nominales de Microlophus en Chile, existen incongruencias evidentes relacionadas con su distribución geográfica, hábitat y ecología, por lo que se intenta entregar una determinación confi able, para lo que se comparó el material tipo con muestras actuales y se revisaron las descripciones originales de ambas especies. Además, se realizaron análisis exhaustivo tanto morfológicos (i.e., escutelación, morfometría lineal y morfometría geométrica) como molecular (cytb). Los resultados muestran que: 1) M. heterolepis fue descrita originalmente para la localidad de Tacna en Perú, 2) las descripciones morfológicas realizadas por Donoso-Barros (1966) corresponden a una lagartija de desierto interior, pero sus características biológicas fueron descritas erróneamente como un habitante del intermareal y 3) hay coincidencia con autores previos en que ambas especies son válidas. Sobre la base de estos resultados, se restringe la distribución geográfica de M. heterolepis a Perú, mientras que M. yanezi es una especie válidamente descrita para Chile.