Today new generation sequencing (NGS) technologies allow a more accurate analysis  of  the  bacterial  composition  of  a  microbiota.  Additionally,  they  have  contributed to the understanding of the role that prokaryotes play in endodontic pathogenesis. The sequencing of the hypervariable regions V3 and V4, a segment of the 16S rRNA gene, to evaluate diversity together with sequencing by synthesis (e.g. Illumina  MiSeq)  has  made  it  possible  to  elucidate  how  clinical  patterns  influence the structure of the bacterial community.Hoy en día, las tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS) permiten un análisis más preciso de la composición bacteriana de una microbiota. Además, han contribuido a la comprensión del papel que juegan los procariotas en la patogénesis endodóntica. La secuenciación de las regiones hipervariables V3 y V4, un segmento del gen 16S rRNA, para evaluar la diversidad junto con la secuenciación por síntesis (por ejemplo, Illumina MiSeq) ha permitido dilucidar cómo los patrones clínicos influyen en la estructura de la comunidad bacteriana.