Chile is experiencing a process of demographic aging with an increase in the number of elderly people, a percentage of which resides in Long-term Establishments for the Elderly (LEE). However, there is little information on the reality of the elderly in these long-term care facilities, so this study was conducted to compare the epidemiological profile of the prevalent oral pathologies as well as chronic non-communicable diseases (NCDs), of institutionalized versus non-institutionalized elderly subjects. Seventy-six institutionalized and forty-three non-institutionalized subjects were examined intraorally, and their clinical health record, gender and age were obtained, according to inclusion/exclusion criteria. The results indicate that female gender is the most common, with an average age of 78.5 year, with those 80 years old and above comprising the predominant group. The most prevalent oral lesions within the institutionalized group were denture stomatitis and irritative hyperplasia, while in the non-institutionalized these two lesions were found less frequently. As for the presence of xerostomia, there was no difference between the groups. The most common condition in both groups was total maxillary and mandibular edentulous, with the latter variable present more frequently in the institutionalized group (p<0.05). The predominant NCD for both groups were arterial hypertension, arthritis-osteoarthritis and diabetes mellitus (p>0.05), and depression was the most prevalent NCD in the non-institutionalized group (p<0.05). This study provides valuable information on the epidemiology of elderly´s oral lesions and NCDs to inform the decision-making process of public health policies.Chile está experimentando un proceso de envejecimiento demográfico con un aumento en el número de personas mayores, un porcentaje del cual reside en establecimientos de larga duración para personas mayores (LEE). Sin embargo, existe poca información sobre la realidad de los ancianos en estos centros de atención a largo plazo, por lo que este estudio se realizó para comparar el perfil epidemiológico de las patologías orales prevalentes, así como las enfermedades crónicas no transmisibles (ENT), de institucionalizadas versus sujetos mayores no institucionalizados. Se examinaron setenta y seis sujetos institucionalizados y cuarenta y tres no institucionalizados por vía intraoral, y se obtuvieron sus antecedentes clínicos, sexo y edad, de acuerdo con los criterios de inclusión / exclusión. Los resultados indican que el género femenino es el más común, con una edad promedio de 78.5 años, y los de 80 años y más comprenden el grupo predominante. Las lesiones orales más frecuentes dentro del grupo institucionalizado fueron la estomatitis protésica y la hiperplasia irritante, mientras que en las no institucionalizadas estas dos lesiones se encontraron con menos frecuencia. En cuanto a la presencia de xerostomía, no hubo diferencia entre los grupos. La condición más común en ambos grupos fue el maxilar total y el edéntulo mandibular, con la última variable presente con mayor frecuencia en el grupo institucionalizado (p<0.05). Las ENT predominantes para ambos grupos fueron hipertensión arterial, artritis-osteoartritis y diabetes mellitus (p> 0.05), y la depresión fue la ENT más prevalente en el grupo no institucionalizado (p <0.05). Este estudio proporciona información valiosa sobre la epidemiología de las lesiones orales y las ENT de los ancianos para informar el proceso de toma de decisiones de las políticas de salud pública.