Native fi sh populations are decreasing due to several impact factors of the environment. In order to address this problem, several actions, for example stocking, have been accomplished. However, if these actions are undertaken without any scientifi c support, their effi ciency is low, and they can cause loss of genetic diversity in the populations, and irreversible impacts in the next generations. For this reason, the use of molecular markers to assess diversity through genetic monitoring, can contribute to the conservation of the icthyofauna. Las poblaciones de peces nativos están disminuyendo debido a varios factores que impactan en el ambiente. Como forma de abordar este problema, se han realizado varias acciones como por, ejemplo, el repoblamiento. Sin embargo, estas acciones se realizan sin ningún respaldo científi co. Esto puede, además de no ser efi ciente, provocar una pérdida de la diversidad genética en las poblaciones, pudiendo ocasionar impactos irreversibles en las próximas generaciones. Por esta razón, el empleo de marcadores moleculares, que permitan monitorear genéticamente las poblaciones parece fundamental para lograr la conservación de la ictiofauna.