Introduction: There is no hematological marker that reliably differentiates between bacterial and nonbacterial acute gastroenteritis (AGE). The objective of this study is to evaluate procalcitonin (PCT) as a marker for bacterial AGE and analyze its relationship with hospital admission. Patients and Method: A prospective study of children diagnosed with AGE was conducted at the emergency room during a period of seven months, which required blood and stool samples. Epidemiological, clinical and analytical variables were analyzed. Patients with chronic digestive disease, prolonged diarrhea, immunodeficiency or prior antibiotic treatment were excluded. The study was approved by the Ethics Committee and an informed consent was requested. Results: 45 patients were analyzed. Children with bacterial GEA were older (p = 0.027) and presented higher median PCT and C-reactive protein concentrations (CRP) (p = 0.001). The PCT and CRP values that best discriminated bacterial infection were PCT ≥ 0.05 mg/L (sensibility 64.3%, specificity 83.9%, positive probability coefficient (PPC): 4), and CRP ≥ 3mg/dL (sensibility 78.6%, specificity 90.3%, PPC: 8). No association between the elevation of these markers and higher hospitalization probability was found. Conclusion: Procalcitonin, like CRP, is elevated in bacterial gastroenteritis (p = 0.001), but these markers are not a predictor of hospitalization.Introducción: No hay ningún marcador hematológico que diferencie con seguridad entre gastroenteritis aguda (GEA) bacteriana y no bacteriana. Nuestro objetivo fue evaluar la procalcitonina (PCT) como marcador de GEA de origen bacteriano y analizar su correlación con el ingreso hospitalario. Pacientes y Método: Estudio prospectivo de niños diagnosticados de GEA en el departamento de Urgencias durante un período de 7 meses que requirieron de analítica sanguínea y muestras de heces. Se analizaron variables epidemiológicas, clínicas y analíticas. Se excluyeron pacientes con enfermedad digestiva crónica, diarrea prolongada, inmunodeficiencia o tratamiento antibiótico previo. El estudio fue aprobado por el Comité de Ética y se solicitó consentimiento informado. Resultados: Se analizaron 45 pacientes. Los niños con GEA bacteriana tenían mayor edad (p = 0,027), mayor mediana de PCT y proteína C reactiva (PCR) (p = 0,001). Los valores de PCT y PCR que mejor discriminaron la etiología bacteriana fueron PCT ≥ 0,5 mg/L (sensibilidad: 64,3%, especificidad: 83,9%, cociente de probabilidad positivo (CPP): 4) y PCR ≥ 3 mg/dL (sensibilidad: 78,6%, especificidad: 90,3%, CPP: 8). No se encontró asociación entre la elevación de dichos marcadores y una mayor probabilidad de hospitalización. Conclusión: La procalcitonina, al igual que la PCR, se eleva en gastroenteritis bacterianas (p = 0,001), no siendo estos marcadores predictores de hospitalización.