Introduction: Esophageal atresia (EA) is the interruption of the continuity of the esophagus, with or without persistent communication with the trachea. Recent advances in surgical techniques have made possible correction with minimally invasive surgery (MIS). Objective: To evaluate the management of thoracoscopic technique in the treatment of EA. Patients and Method: Retrospective analysis of medical records in two centers was carried out between 2007 and 2012. Variables such as gestational age, gender, weight, type of esophageal atresia, malformations, surgery and postoperative complications were recorded. Results: Twenty patients, 15 of them with type III EA, 4 with type I and one unclassifiable, were part of the study. 13 patients underwent ligation, cut of tracheoesophageal fistula and end to end anastomosis. Two underwent laparoscopic gastrostomy and fistula ligation. One patient required conversion and underwent esophagostomy plus gastrostomy. 4 patients without fistula required laparoscopic gastrostomy and aspiration of the proximal esophagus to be able to perform esophageal anastomosis. In the postoperative period, pleural drainage and a transanastomotic feeding tube were installed. Seven patients required esophageal dilations and 4 patients developed stenosis due to reflux. Two had recurrent fistula, one with spontaneous resolution and another with endoscopic resolution. Three children died: two of them due to pathologies not related to surgery and one as a result of limitation of therapeutic effort after fistula patency. Discussion: Esophageal atresia repair with MIS is a safe and effective option with excellent exposure and visualization of anatomic landmarks and little associated morbidity.Introducción: Atresia esofágica (AE) es la interrupción de la continuidad del esófago, con o sin comunicación con la tráquea. Los avances en cirugía han permitido su corrección con cirugía mínimamente invasiva (CMI). Objetivo: Evaluar el manejo toracoscópico en AE. Pacientes y Método: Revisión retrospectiva de fichas de 2 centros entre 2007 y 2012. Se registraron variables como edad gestacional, sexo, peso, tipo de atresia esofágica, malformaciones, cirugías y complicaciones postquirúrgicas. Resultados: Veinte pacientes, 15 tipo III, 4 tipo I y uno no clasificable. En 13 pacientes se realizó ligadura, sección de fístula tráqueo-esofágica y anastomosis término-terminal. Dos fueron sometidos a gastrostomía laparoscópica más ligadura de fístula. Un paciente requirió conversión y se realizó esofagostomía más gastrostomía. En 4 pacientes sin fístula, se realizó gastrostomía laparoscópica y aspiración del esófago proximal hasta lograr realizar la anastomosis esofágica. En el post-operatorio se instaló drenaje pleural y sonda trans-anastomótica. Siete pacientes requirieron dilataciones esofágicas y 4 desarrollaron estenosis por reflujo. Dos presentaron fístula recidivada, uno con resolución espontánea y el segundo de resolución endoscópica. Tres niños fallecieron: dos por patologías no relacionadas con la cirugía y uno con limitación de esfuerzo terapéutico con repermeabilización de fístula. Discusión: La atresia esofágica reparada con CMI es una opción segura y efectiva en esta serie, permitiendo excelente exposición y visualización de reparos anatómicos, con poca morbilidad asociada.