Nothofagus alessandrii is an endangered species that is endemic to the Mediterranean area of Chile. There is no information on the anatomical structure of its seeds and there are few studies on the morphometric and germination differences between its populations. Therefore, the purpose of this study was to describe the morpho-anatomical structure of seeds of N. alessandrii in order to compare the morphology and germination four geographically distinct populations. This was done by selecting seeds of four different origins covering the entire latitudinal distribution of the species and measuring their size, shape, dry weight and germination in order to perform a comparative analysis. Results showed that the anatomical structure of N. alessandrii seeds is similar to that of other species of the Fagaceae family such as Fagus sylvatica. No differences were found between seeds from the four different origins in morphological characteristics or germinative power. Thus, it was not possible to demonstrate the existence of clinal variation, although the southernmost population showed differences in length and weight, suggesting that it may belong to a different ecotype.Nothofagus alessandrii es una especie endémica del área Mediterránea de Chile, de la cual no se cuenta con información sobre la estructura anatómica de sus semillas. Existen muy pocos estudios sobre la variabilidad morfológica y de germinación entre sus poblaciones. El objetivo de este estudio fue describir la estructura morfoanatómica de semillas de N. alessandrii con el fin de comparar la morfología y la germinación entre cuatro poblaciones geográficamente separadas. Se seleccionaron semillas de cuatro orígenes geográficos a lo largo de la distribución latitudinal de la especie, y se midieron el tamaño, la forma, el peso seco, y la germinación. Los resultados mostraron que las semillas de N. alessandrii tienen una estructura anatómica similar a la de otras especies de la familia Fagaceae como Fagus sylvatica. No se encontraron diferencias significativas en las características morfológicas de los lotes estudiados, ni tampoco en el poder germinativo, por lo que no se ha observado una variación clinal entre poblaciones, aunque la población localizada más al sur presentó variaciones en longitud y peso, sugiriendo la posibilidad de ecotipo diferenciado.