The lichen mycobiota of Aisen (southern Chile) comprises 319 taxa in 87 genera. All of the species of Menegazzia andProtousnea, previously recorded in Chile, are present in this region. The diversity of biomes, from temperate rainforests?particularly in oceanic zones? to steppe areas, offers an enormous number of macro and microhabitats favorable forlichens. The highest lichen diversity, 56 %, was recorded in an undisturbed locality in Laguna San Rafael National Park.Lichen species diversity is higher in oceanic temperate rainforests than in steppe areas, where the majority of Antarcticlichens (23 %) are registered. Levels of endemism are rather high (26 %) and are due mainly to species of the generaProtousnea, Pseudocyphellaria, Menegazzia, Cladonia, Sticta, Nephroma. Other biogeographical elements in the región’slichen mycobiota are: cosmopolitan (16 %), austral (16 %) and bipolar (13 %). Lichen diversity in Aisen represents about20 % of the known lichen mycobiota of Chile.La micobiota liquénica de la Región de Aisén incluye 319 especies en 87 géneros; el número total de especies de los génerosMenegazzia y Protousnea registrados en Chile se encuentran en esta región. La diversidad de biomas, desde bosquestemplado-lluviosos, particularmente en zonas oceánicas, a áreas estepáricas, ofrece una variedad de macro y microhabitatsfavorables para los líquenes. La mayor diversidad liquénica (56 %) se registró en un área silvestre no intervenida en elParque Nacional Laguna San Rafael. La diversidad específica es más elevada en bosques templado-lluviosos que en zonasestepáricas, en estas últimas se registró la mayoría de los líquenes antárticos (23.0 %). El endemismo es más bien elevado(26.0 %); numerosas especies de los géneros Protousnea, Pseudocyphellaria, Menegazzia, Cladonia, Sticta, Nephromason endémicas del sur de América del Sur. Las especies cosmopolitas (16 %), australes (16 %) y bipolares (13 %) son loselementos biogeográficos más representativos. La diversidad liquénica de Aisen corresponde al 20 % de la flora liquénicade Chile.