The need to foster public policies and strategies to promote the inclusion of cities and regions in the knowledge economy became permanent and crucial for urban planners. This work specifically explores the relationship between Knowledge Based Urban Development (KBUD) and Innovation Ecosystems (IEs) in urban areas. A conceptual model, based on triangulation methods, is proposed and applied in four Brazilian ecosystems awarded for their performances. We found that: (i) There are major conceptual similarities between KBUD and IEs, leading to harmony of understandings; (ii) KBUD and IEs are sociotechnical events that occur in urban areas, revealing relationships that are intrinsic for the KBUD, and are desirable and not mandatory for the IEs; (iii) there is convergence of interests and activities issued from KBUD and IEs; and (iv) KBUD´s development perspectives can positively influence the results and impacts pursued by IEs. Recommendations emerge from the combination of these findings. These can help support the decision-making processes of innovation managers and urban planners, in order to obtain more integrated planning and thus encourage the emergence of IEs.El esfuerzo en promover políticas públicas y estrategias que favorezcan la inserción de ciudades y regiones en la economía del conocimiento se ha vuelto constante e imperativo para los planificadores urbanos. Este trabajo se dedica a este desafío y explora específicamente las relaciones entre el Desarrollo Urbano Basado en el Conocimiento (DUBC) y los Ecosistemas de Innovación (EI) en el medio urbano. A partir de una investigación por triangulación, se concibió un modelo conceptual y se analizaron cuatro premiados ecosistemas de ciudades brasileñas. Se concluyó que: (i) hay armonía entre el DUBC y los EI, debido a importantes similitudes conceptuales; ii) el DUBC y los EI son manifestaciones socio-técnicas que ocurren en el medio urbano, con relaciones intrínsecas en el caso del DUBC, y deseables pero no obligatorias en el de los IE; (iii) hay convergencia de intereses y de actuación de los DUBC y de los EI; y iv) el DUBC puede influenciar positivamente los resultados e impactos buscados por los EI, en particular por la adecuada implantación de perspectivas económicas, socioculturales, institucionales, ambientales y urbanas. De la combinación de estas conclusiones surgen recomendaciones para subsidiar el proceso decisorio de gestores de innovación y planificadores urbanos y, así, obtener una planificación integrada que induzca más fácilmente el surgimiento de EI.O esforço em promover políticas públicas e estratégias que favoreçam a inserção de cidades e regiões na economia do conhecimento tornou-se constante e imperativo para os planejadores urbanos. Este trabalho dedica-se a este desafio e explora especificamente as relações entre o Desenvolvimento Urbano Baseado em Conhecimento (DUBC) e os Ecossistemas de Inovação (EI) no meio urbano. A partir de uma pesquisa por triangulação concebeu-se um modelo conceitual e foram analisados quatro premiados ecossistemas de cidades brasileiras. Concluiu-se que: (i) há harmonia entre DUBC e os EIs, devido a importantes similaridades conceituais, ii) o DUBC e os EIs são manifestações sociotécnicas que ocorrem no meio urbano, havendo intrínseca relação do DUBC com este meio, enquanto que esta relação é desejável, mas não obrigatória, para os EIs, iii) há convergência de interesses e de atuação dos DUBC e dos EIs e iv) o DUBC pode influenciar positivamente os resultados e impactos buscados pelos EIs, em particular pela adequada implantação de perspectivas econômica, sociocultural, institucional, ambiental e urbana. Da combinação destas conclusões emergem recomendações para subsidiar o processo decisório de gestores de inovação e planejadores urbanos e, assim, obter-se planejamento integrado que induza mais facilmente o surgimento de EIs.