This article analyzes the problems of coordination in the implementation of health measures by the government of Bogotá to address the Covid-19 pandemic. It establishes that in a context of decentralization, in which the Political Constitution of 1991 recognizes territorial autonomy, but in which a relationship of dependence with the central government is still maintained, the health crisis resulting from the increase of positive cases of Covid-19 revealed failures in intergovernmental relations. Based on the nested model of capacities, it is proposed that the interaction between operational, organizational, and political capacities is a necessary condition to achieve effective results and that the lack of political astuteness and negotiation is a sufficient condition for implementation failures.Este artículo analiza los problemas de coordinación en la implementación de medidas de salud por parte del gobierno de Bogotá para atender la pandemia por Covid-19. Se establece que bajo un contexto de descentralización, en el que la Constitución Política de 1991 reconoce la autonomía territorial, pero en el que aún se mantiene una relación de dependencia con el gobierno central, la crisis sanitaria producto del aumento de casos positivos por Covid-19 dejó en evidencia fallas en las relaciones intergubernamentales. A partir del modelo anidado de capacidades, se plantea que la interacción entre capacidades operacionales, organizativas y políticas son una condición necesaria para lograr resultados efectivos y que la falta de astucia y negociación política es una condición suficiente para las fallas de implementación