The shark-parasite associations for most shark species in Chile are poorly known. Thus, the purpose of this study was to analyze the parasite community of two shark species from Southern Chile. A total of 24 specimens of the southern lanternshark Etmopterus granulosus, and seven specimens of the narrowmouthed catshark Schroederichthys bivius were collected from the Strait of Magellan during January of 2017 and 2018. We recorded a total of 87 parasites associated with the examined E. granulosus and 192 parasites associated with the examined S. bivius, with higher average of parasite abundance in the latter species (27.5 ± 25.5 parasites/host) compared to E. granulosus (3.5 ± 3.3 parasites/host). A few parasites were prevalent and abundant; the nematodes Pseudoterranova sp. (41.7% prevalence; 1.46 parasites/host) and Anisakis sp. (29.2% prevalence; 1.21 parasites/host) present in E. granulosos, whereas the copepod Tautochondria sp. (85.7% prevalence; 9.14 parasites/host) and the nematode Proleptus niedmanni (71.4% prevalence; 14.86 parasites/host) present in S. bivius. Similitude in terms of parasite composition between the two shark species was low (14.6%). Thus, despite the sympatry of the two sharks species analyzed in this study, the parasite composition was different because only two parasite species were shared, the anisakid nematodes Pseudoterranova sp. and Anisakis sp. Therefore, the difference in parasite composition of the E. granulosus and S. bivius could be due to their evolutionary history, involving several differences in the ecology of the hosts.En la presente investigación se analizó la comunidad de parásitos de dos especies de tiburones del sur de Chile debido al escaso conocimiento de la relación entre parásitos y tiburones de la zona. Un total de 24 especímenes del tiburón linterna Etmopterus granulosus y siete especímenes de la pintarroja del sur Schroederichthys bivius fueron recolectados en el estrecho de Magallanes en enero de 2017 y 2018. Se encontró un total de 87 individuos de parásitos pertenecientes a siete especies de parásitos en E. granulosus y 192 individuos de parásitos de siete especies en S. bivius. La abundancia promedio de parásitos fue mayor en la pintarroja del sur que en el tiburón linterna, con 27,5 ± 25,5 parásitos/hospedero y 3,5 ± 3,3 parásitos/hospedero, respectivamente. Pocos parásitos fueron prevalentes y abundantes; tales como los nematodos Pseudoterranova sp. (41,7% de prevalencia; 1,46 parásitos/pez) y Anisakis sp. (29,2% de prevalencia; 1,21 parásitos/pez) presentes en E. granulosus, y el copépodo Tautochondria sp. (85,7% de prevalencia; 9,14 parásitos/pez) y el nematodo Proleptus niedmanni (71,4% de prevalencia; 14,86 parásitos/pez) presentes en S. bivius. La similitud en la composición de especies parásitas fue baja entre E. granulosus y S. bivius (14,6%), ya que sólo dos especies de parásitos, los anisákidos Pseudoterranova sp. y Anisakis sp., fueron compartidos entre ambos hospederos, a pesar de ser especies simpátricas. Por tanto, la desigual composición de los parásitos entre ambas especies de tiburones podría explicarse por sus historias evolutivas distintas, que implican numerosas diferencias ecológicas entre los hospederos.