Analysis of genetic diversity and differentiation of Prosopis chilensis populations between Chacabuco and San Felipe de Aconcagua provinces using microsatellite molecular markers
Análisis de diversidad y estructura genética de poblaciones de Prosopis chilensis entre las provincias de Chacabuco y San Felipe de Aconcagua, usando marcadores moleculares microsatélites
| dc.creator | Contreras Díaz, Roberto | |
| dc.creator | González González, Marlene | |
| dc.creator | Aguayo Cruces, Fernanda | |
| dc.creator | Gacitúa Arias, Sandra | |
| dc.creator | Porcile Saavedra, Vincenzo | |
| dc.date | 2021-12-27 | |
| dc.date.accessioned | 2021-12-30T15:36:04Z | |
| dc.date.available | 2021-12-30T15:36:04Z | |
| dc.identifier | http://revistas.uach.cl/index.php/bosque/article/view/6842 | |
| dc.identifier | 10.4067/S0717-92002021000300371 | |
| dc.identifier.uri | https://revistaschilenas.uchile.cl/handle/2250/177319 | |
| dc.description | Prosopis chilensis is a native species of Chile distributed from Tarapacá Region to O’Higgins Region; however, despite its wide extension, the diversity, differentiation and genetic structure of its populations have not been studied. The objectives of the present study were to determine the level of genetic diversity and evaluate the genetic differentiation and population structure of P. chilensis from the central zone of Chile using seven microsatellite markers. A total of 53 alleles were detected among individuals of P. chilensis. The PIC value ranged from 0.057 (Mo05) to 0.847 (Mo16) with an average PIC of 0.636. The expected heterozygosity averaged 0.610 and the observed heterozygosity averaged 0.588. The inbreeding coefficient (FIS) for each population varied between 0.028 and 0.103. The AMOVA analysis revealed that the greatest amount of genetic variation was found among individuals (90.78 %, P = 0.0001) rather than among populations of P. chilensis (0.16 %, P = 1.000). The level of genetic differentiation of P. chilensis was very low (FST = 0.0015) among the four populations (LAPO, HUPE, ANDE and ENDO). The STRUCTURE analysis, the Mantel test and the EMD analysis indicate that all individuals are part of a single structure, there being no evidence of barriers that generate isolation. Therefore, in the future it will be necessary to carry out more population studies of this species, in such a way to detect variation and expand the genetic groups to maintain genetic richness and biodiversity of the ecosystems. | en-US |
| dc.description | Prosopis chilensis es una especie nativa de Chile distribuida desde la Región de Tarapacá hasta la Región del O’Higgins, sin embargo, a pesar de su amplia extensión, no se ha estudiado la diversidad, diferenciación y estructura genética de sus poblaciones. El objetivo del presente estudio fue determinar el nivel de diversidad genética, evaluar la diferenciación genética y estructura de poblaciones de P. chilensis de la zona central de Chile a partir de siete marcadores microsatélites. Un total de 53 alelos fueron detectados entre individuos de P. chilensis. El valor PIC varió desde 0,057 (Mo05) a 0,847 (Mo16) con un PIC promedio de 0,636. La heterocigosidad esperada tuvo un promedio de 0,610 y la heterocigosidad observada tuvo un promedio de 0,588. El coeficiente de endogamia (FIS) para cada población varió entre 0,028 y 0,103. El análisis AMOVA reveló que la mayor cantidad de variación genética se encontró entre individuos (90,78 %; P = 0,0001) que entre poblaciones de P. chilensis (0,16 %; P = 1,000). El nivel de diferenciación genética de P. chilensis fue muy bajo (FST = 0,0015) entre las cuatro poblaciones (LAPO, HUPE, ANDE y ENDO). El análisis STRUCTURE, la prueba de Mantel y el análisis EMD indican que todos los individuos son parte de una sola estructura, no habiendo indicios de barreras que generen aislamiento. Por lo tanto, en el futuro será necesario realizar más estudios de población de esta especie, de tal manera de detectar variación y ampliar los grupos genéticos con el fin de mantener su riqueza genética y la biodiversidad de los ecosistemas. | es-ES |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | spa | |
| dc.publisher | Universidad Austral de Chile, Facultad de Ciencias Forestales y Recursos Naturales. | es-ES |
| dc.relation | http://revistas.uach.cl/index.php/bosque/article/view/6842/7750 | |
| dc.rights | Derechos de autor 2021 BOSQUE | es-ES |
| dc.source | BOSQUE; Vol. 42 Núm. 3 (2021); 371-382 | en-US |
| dc.source | BOSQUE; Vol. 42 Núm. 3 (2021); 371-382 | es-ES |
| dc.source | 0717-9200 | |
| dc.source | 0304-8799 | |
| dc.title | Analysis of genetic diversity and differentiation of Prosopis chilensis populations between Chacabuco and San Felipe de Aconcagua provinces using microsatellite molecular markers | en-US |
| dc.title | Análisis de diversidad y estructura genética de poblaciones de Prosopis chilensis entre las provincias de Chacabuco y San Felipe de Aconcagua, usando marcadores moleculares microsatélites | es-ES |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | |
| dc.type | Peer-reviewed article | en-US |
| dc.type | Artículo evaluado por pares | es-ES |
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Bosque
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