The relationship between State and Church during the independence process was complex. In some cases involved doctrinal problems, in others political arguments and sometimes economical issues. In general the literature about these conflicts has been focused in those matters, separating one from another and focusing in the task of discriminate both the loyalties involved (a patriot or monarchist clericals) or the differences between secular and regular clergy. This study attempts to observe those relationships analyzing as a whole the different fields and views that were part of the construction of a new order and the searching for an equilibrium between religious and civil authorities.Las relaciones entre Estado e Iglesia durante el proceso de emancipación configuraron una situación compleja. En algunos casos, se trataba de problemáticas doctrinarias, en otras, políticas y no faltaron aquellas de carácter económicas. En lo general, los estudios al respecto han focalizado independientemente aquellos aspectos y se han detenido más en clarificar el carácter realista o patriota de las jerarquías eclesiásticas y de los cleros secular y regular. Este artículo intenta observar dichas relaciones analizando en conjunto los distintos ámbitos y aspectos en que confluyeron los ordenamientos del nuevo orden y la búsqueda de equilibrios entre las autoridades civil y religiosa.