Studies have established that the adopting e-filing systems reduces the costs of tax compliance, as well as the frequency of firms being visited by officials of the State administration. This has led Latin America countries to implemented tax audits by connecting directly to the electronic systems of taxpayers. Nevertheless, this type of audits conceals a more complex conflict in the face of the violation of the rights of taxpayers. Thus, the present article provides a systematic and technical analysis on how the countries under study have developed tax audit procedures through electronic systems, whose evidences show asymmetries in the normative regulation against the rights of taxpayers.Estudios han establecido que la adopción de sistemas de declaración electrónica reduce los costos de cumplimiento tributario, como también la frecuencia de las empresas visitadas por funcionarios de la administración del Estado. Esto ha derivado en que países de Latino América implementen auditorías tributarias conectándose directamente a los sistemas electrónicos de los contribuyentes. Sin embargo, este tipo de auditorías oculta un conflicto más complejo frente a la vulneración de los derechos de los contribuyentes. Así, el presente artículo entrega un análisis sistemático y técnico sobre la forma como los países en estudio han desarrollado procedimientos de auditoría tributaria a través de sistemas electrónicos, cuyas evidencias demuestran asimetrías en la regulación normativa frente a los derechos de los contribuyentes.