This study examines the Phenotypic variability of maize from the Archaeological site Caserones-1, comparing seven characters in samples from two periods: Formative and Late Intermediate (LIP) (cal. 20-1.020 d.C.). Considering the ancient relationship between this species and several human groups in America (ca. 7.500 AP), as well as the general tendency of genetic variability to decrease as a consequence of selection and domestication, the hypothesis presented here focuses on decreasing phenotypic variability from the Formative to the Late Intermediate Period as a result of anthropic processes. The findings depict an inverse panorama: according to Principal Component Analyses, length is the characteristic showing the most intense transformation across both periods, considerably increasing in the upper range, and in the variability reached during the Formative Period. These results offer valuable evidence on the dynamics of selection and anthropic processes by some communities at pre-Hispanic Tarapacá.En este artículo se analiza la variabilidad fenotípica del maíz en el sitio Caserones-1, comparando siete caracteres entre ejemplares pertenecientes a dos períodos: Formativo e Intermedio Tardío (cal. 20-1.020 d.C.). Considerando la antigua relación entre esta especie y diversos grupos humanos en América (ca. 7.500 AP), así como la tendencia generalizada a la disminución de la variabilidad genética como resultado de los procesos de selección y domesticación, es que aquí ponemos a prueba la hipótesis de disminución de la variabilidad fenotípica desde el Formativo al Período IntermedioTardío como consecuencia del manejo antrópico. Los resultados aquí mostrados refutan la hipótesis anterior, describiendo un panorama inverso: de acuerdo al Análisis de Componentes Principales, la longitud es el atributo que presenta la transformación más intensa entre estos dos periodos, ampliando considerablemente su rango superior e incrementando la variabilidad alcanzada en el Formativo. Estos resultados aportan evidencia sobre las dinámicas de selección y manejo antrópico por parte de algunas comunidades prehispánicas tarapaqueñas, las que aquí son interpretadas como espacios de experimentación agrícola desde el Formativo Tardío.