Introduction: Health reforms have introduced independently managed health care establishments into the health care network. This study explored the perceptions of professional hospital workers with respect to the current stage of policy implementation independently managed establishments, in a high complexity hospital in the south of Chile. Materials and methods: Qualitative single case study based on semi-structured in-depth interviews conducted with health professionals at the San Jose Hospital in the city of Osorno, from August 2010 to December 2011. A sample of 19 professionals was chosen, and the interviews were recorded and transcribed. The analysis was carried out using conventional content analysis. Results: For the interviewees, independent management was conceptualized as autonomy in the decisión making process, with respect to resource distribution and financing. Likewise, recognized weaknesses were related to the absence of organizational capacity and competency within management for implementing changes. According to these professionals, policy options for human resources and for financing of health services provision should be included in order to improve the implementation stage. Discussion: Independent hospital management is conceptualized mainly as financial autonomy. Likewise, implementation has been stalled by persisting gaps between design and implementation in independent hospital management policy.Introducción: La reforma de la salud introdujo la figura de los Establecimientos de Autogestión en Red. La investigación tuvo por objetivo explorar las percepciones de los profesionales hospitalarios con relación a la etapa de implementación de la política de Establecimientos de Autogestión en Red en un hospital de alta complejidad en el sur de Chile. Material y método: Estudio cualitativo de caso único holístico basado en entrevistas semi-estructuradas en profundidad a profesionales de la salud del Hospital San José de la ciudad de Osorno durante el período de agosto de 2010 a diciembre de 2011. Se seleccionó una muestra intencionada de 19 profesionales. Se realizaron 19 entrevistas, las cuales fueron grabadas y transcritas en forma literal. El análisis de las entrevistas se realizó mediante la técnica de análisis de contenido en su aproximación convencional. Resultados: Para los entrevistados, la conceptualización de la autogestión está determinada por la autonomía para la toma de decisiones respecto de la asignación de recursos y el financiamiento. Asimismo, las debilidades se relacionaron a la ausencia de capacidades organizacionales y competencias gerenciales de los equipos de salud para la implementación de los cambios. Para los profesionales, para mejorar la etapa de implementación se deben  incluir opciones de políticas de recursos humanos y de financiamiento de la función de provisión. Discusión: La política de autogestión hospitalaria es conceptualizada desde la autonomía financiera. Asimismo, la implementación ha estado determinada por las brechas que persisten entre el diseño e implementación de la política de autogestión hospitalaria en red.