El distrito de la Audiencia del Nuevo Reino de Granada, entendiendo por tal el territorio dentro del cual el organismo ejercía jurisdicción, sufrió desde su creación y a lo largo de los siglos XVI y XVII diversas modificaciones. En 1549 el Rey dio una Provisión Real en la cual señalaba las provincias que inicialmente quedaban sujetas a ella:"A vos los nuestros gobernadores y otros jueces cualesquier de las provincias de Santa Marta, y Nuevo Reino de Granada y de Popayán y Río de San Juan."'