Systems thinking contributed to the origin of agroecological thought, which had as primordial theoretical basis the contributions from the general systems theory and cybernetics. Thus, agroecology in the 70s of the last century could establish itself as a new way of thinking and doing science related to agricultural activity to try to go beyond the dominant reductionist approach. However, the study of contemporary agricultural reality demands new approaches to understand it in its many dimensions. Accordingly, the purpose of this study was to analyze the evolution of systems thinking and its significance in the agro-ecological thinking by providing theoretical and conceptual tools to study current agricultural phenomena through complex systems, including unexplored aspects in its traditional approach as history, politics and culture.El pensamiento sistémico contribuyó al origen del pensamiento agroecológico con aportaciones desde la teoría general de sistemas y la cibernética como su base teórica primigenia. Así, la agroecología en los años 70 del siglo pasado pudo erigirse como una nueva forma de pensar y hacer ciencia en relación con el quehacer agrícola al intentar ir más allá del enfoque reduccionista predominante. El estudio de la realidad agrícola contemporánea exige planteamientos nuevos que permitan comprender sus dimensiones, para lo cual los principios basados en el modelo input-output que funciona bajo un controlador cibernético resultan insuficientes. En consecuencia, el propósito de este manuscrito fue analizar la evolución del pensamiento sistémico y su trascendencia en el pensamiento agroecológico, al brindar a éste último herramientas teórico-conceptuales para estudiar fenómenos agrícolas actuales a través de los sistemas complejos, y con ello, involucrar aspectos poco explorados en su abordaje tradicional como la historia, la política y la cultura.