Objetivo: Determinar los cambios de un protocolo periodizado de entrenamiento concurrente en niños y adolescentes con sobrepeso y obesidad que asistieron a un programa de rehabilitación cardiometabólica del Hospital Dr. Exequiel González Cortés.Pacientes y métodos: 32 pacientes divididos en dos grupos, intervención (INT) (n=22; edad: 12,9 ± 2,7) y control (CON) (n=10; edad: 12, 6 ± 2,5). El INT realizó 12 semanas de entrenamiento periodizado concurrente, aquellos que voluntariamente abandonaron el programa se unieron al CON. Las mediciones se realizaron en 3 días consecutivos: día 1, evaluación pre participativa cardiovascular y antropometría; día 2, capacidad aeróbica y función muscular; día 3 perfil lipídico y control glicémico.Resultados: El INT disminuyó el índice de masa corporal (IMC) (-2,5 ± 3,4%; P=0,001), IMC z-score (-4,78 ± 10,33; P=0,0026), circunferencia de cintura (-5,2 ± 6,1%; P=0,0004) y razón cintura estatura (-6,1 ± 6,0%; P<0,0001). El consumo máximo de oxígeno estimado por Shuttle 20m run test (6,7 ± 6,6%; P<0,0001) y metros recorridos (69,8 ± 113,6%; P<0,0001) mejoraron en el INT. La flexo – extensión de codos (497,3 ± 398,8%; P=0,0001), salto largo a pies juntos (31,2 ± 105,3%; P=0,004) y plancha prona (261,2 ± 209,8%; P<0,0001), mejoraron en el INT. El INT disminuyó el colesterol total (-11,3 ± 5,3%; P=0,02). No se encontraron diferencias significativas en control glicémico entre grupos.Conclusiones: Un protocolo periodizado de entrenamiento concurrente de doce semanas es efectivo en mejorar la antropometría, capacidad aeróbica, función muscular y colesterol total en niños y adolescentes con sobrepeso y obesidad.