Using data from the 2015 Ecuadorian Innovation Survey and through the inverse probability weighting methodology, we analyze the impact of innovation support programs on the perception of companies on the obstacles that emerge when registering intellectual property. The results indicate that participating in programs reduces the perception of all obstacles, although only for those companies that use formal appropriation mechanisms to protect their innovations. Additionally, it is observed that programs reduce the perception of obstacles associated with the registration of patents, utility models and industrial designs more than those associated with the registration of trademarks. Based on these results, the suitability of support programs to facilitate the intellectual property registration process is discussed.Utilizando datos de la Encuesta Ecuatoriana de Innovación del 2015 y a través de la metodología de ponderación por probabilidad inversa, se analiza el impacto de los programas de apoyo a la innovación, en la percepción de las empresas sobre los obstáculos al registro de propiedad intelectual. Los resultados indican que participar en programas reduce la percepción de todos los obstáculos a la propiedad intelectual, pero solo de las empresas que utilizan métodos formales de apropiación para proteger sus innovaciones. Adicionalmente, se observa que los programas reducen más la percepción de los obstáculos asociados con el registro de patentes, modelos de utilidad y diseños industriales; que los asociados con el registro de marcas. En base a estos resultados se discute sobre la idoneidad de los programas de apoyo para facilitar el registro de propiedad intelectual.