En este trabajo se estudia la evolución de la investigación científica en la Universidad de Chile, a la luz de la nueva realidad surgida con el financiamiento externo de esta actividad. A juicio de los autores, este hecho, junto a la ausencia de una política destinada a estimular específicamente esta actividad, han traído como consecuencia uan suerte de distanciamiento entre los investigadores y la Universidad, que desfavorece la posibilidad de una accionar institucional común en este importante quehacer académico. Se proponen algunas medidas para fortalecer el vínculo de los investigadores con la Corporación y mejorar la productividad acientífica.