Swietenia macrophylla is a forest species of great commercial value that is categorized as vulnerable in Peru. Therefore, the objective of this study was to optimize a protocol for cutting propagation of S. macrophylla using microtunnels in the San Martín, Peruvian Amazon. Three experiments were conducted: sterilization, which tested ethyl alcohol (EA), Tween-80 (T), carbendazim (CZ), and combinations; a rooting experiment with different substrates and doses of indole-3-butyric acid (IBA); and an acclimation experiment of rooted cuttings, with different shade coverage and relative humidity conditions. The lowest contamination of S. macrophylla cuttings (9.75 %) was achieved with the combined EA-CZ treatment; this treatment resulted in the lowest necrosis (9.1 %) and survival of 86.50 %. The best responses in rooting, root biomass, and cutting survival were presented by the combination of sterilized sand with 3,000 mg L-1 of IBA, with averages of 73.89 %, 0.036 g, and 2.22 cm, respectively. The best acclimation was obtained under 80 % shade and 60 % relative humidity, with an average survival rate of 91.67 %. The general results were successful; therefore, they could be a valuable tool for the rescue, conservation, and restoration of ecosystems with cloned S. macrophylla trees that are resilient to climate changeSwietenia macrophylla es una especie forestal de gran valor comercial, clasificada como vulnerable en Perú. Por esta razón, el objetivo de este estudio fue optimizar un protocolo para la propagación de esquejes de S. macrophylla a través de microtúneles en San Martín, Amazonía Peruana. Se realizaron tres experimentos: esterilización, en el que se probaron alcohol etílico (EA), Tween-80 (T), Carbendazim (CZ) y combinaciones; un experimento de enraizamiento con diferentes sustratos y dosis de Ácido Indol Butírico (AIB); y un experimento de aclimatación de esquejes enraizados, con diferentes coberturas de sombra y condiciones de humedad relativa. La menor contaminación de esquejes de S. macrophylla (9,75 %) se logró con el tratamiento combinado EA-CZ; este tratamiento tuvo la menor necrosis (9,1 %) y una supervivencia de los esquejes del 86,50 %. Las mejores respuestas en enraizamiento, biomasa de raíces y supervivencia de esquejes las presentó la combinación de arena esterilizada con 3.000 mg L-1 de AIB con promedios de 73,89 %, 0,036 g y 2,22 cm, respectivamente. La mejor aclimatación se obtuvo con 80 % de sombra y 60 % de humedad relativa, con una supervivencia promedio de 91,67 %. Los resultados en general son exitosos; por lo tanto, podrían ser una herramienta valiosa para el rescate, conservación, y restauración de ecosistemas con árboles clonados de S. macrophylla resilientes al cambio climático.