El embalse de la presa Jalpan ubicado en Jalpan de Serra, Querétaro, México, dentro de la Reserva de la Biosfera y sitio RAMSAR, alimentado por la escorrentía del agua de la parte alta de la cuenca (cuenca de montaña) cuyo origen está marcado por la actividad minera artesanal de plata, donde los jales mineros se encuentran cerca de los ríos. Transportando así diversos metales que son depositados en el embalse, de gran importancia para el abastecimiento de agua para uso agrícola, doméstico y fines recreativos. Se presenta el análisis de la concentración de arsénico, cadmio y plomo en sedimento mediante absorción atómica realizada en tres sitios muestreados en la capa superficial de 10 cm de profundidad, cuyas muestras fueron obtenidas con un tubo de PVC de 7cm de diámetro, identificadas, conservadas para su traslado y digeridas con ácido nítrico. Las concentraciones medias encontradas fueron en el arsénico 4.278 mg/kg, cadmio 0.323 mg/kg y plomo 4.873 mg/kg, comparándolo con las normativas aplicables el sedimento analizado no representa riesgo para la salud humana o para la flora y fauna que habita en el embalse.