El jesuita Juan Ignacio Molina escribió el Compendio de la Historia Geográfica, Natural y Civil del Reyno de Chile (1776) y el Compendio de la Historia Civil del Reyno de Chile (1787) en el exilio italiano. En los estudios sobre los jesuitas, sus Historias naturales no han sido exploradas en cuanto a la importancia cultural, literaria y crítica que implican. En este trabajo se tratarán algunos rasgos de la escritura de la Historia que constituyen el discurso de la ciencia y que muestran el desarrollo que va desde la Historia natural y moral –que desde Aristóteles y Plinio representa la ciencia clásica– a los nuevos modos de conocer que representa el modelo de ciencia de la Ilustración. En consecuencia, el aporte del Abate Molina en su Compendio de la Historia Civil consiste en incorporar la concepción de progreso en los usos y costumbresde los indígenas, aportando una visión de integración diferente a la civilidad. Sabemos que  con posterioridad al siglo dieciocho el aporte de muchos astrónomos, médicos y científicos jesuitas –en América– construyeron las bases de la ciencia moderna y progresiva, representando la continuidad más que la regresión en el desarrollo científico tal como lo concebimos actualmente.