Esta investigación busca determinar los factores que inciden en que una comuna tenga una mayor o menor asignación de recursos vía proyecto FNDR, dentro de las regiones de Chile, para el período 1997-2012, a través de una metodología cuantitativa. Se concluye que si bien el FNDR es eficaz en propender a una equidad interregional, no lo es al momento de propender a una equidad intra-regional, lo que abre espacio para la innovación institucional.This research seeks the factors that contribute a commune to have a greater or lesser resources allocation from the FNDR project within the regions of Chile, for the period 1997-2012, through a quantitative methodology. We conclude that although the FNDR is effective in tending to interregional equity, it is not effective in the search of intra-regional equity, opening space for institutional innovation.