The study of faunal remains from archaeological sites is based on qualitative and quantitative data that contribute to our understanding of the consumption of animal protein, environment, and lifestyle often goes beyond understanding daily activities. Indeed, faunal remains in archaeological sites vary among societies, as choices are both availability and culturally defined. Here I discuss available faunal data from shell mounds in the Babitonga Bay, in conjunction with the presence of pottery in some of their archaeological layers. Forte Marechal Luz, Enseada I, Bupeva II and Itacoara sites have pottery and two different stratigraphic horizons. The results show some interesting differences in taxa and quantity of the animal remains, when the different layers of the same site and between sites are compared. I discuss cultural identity and diversity of the prehistoric dwellers living in the Babitonga Bay, in the light of a relatively late introduction of ceramics that affected less than 10% of the shell mounds in the area.El estudio de los restos de fauna de los sitios arqueológicos se basa en datos cualitativos y cuantitativos que contribuyen a nuestra comprensión del consumo de proteínas de origen animal, el medio ambiente y estilo de vida, y van a menudo más allá de la comprensión de las actividades diarias. Aquí discuto los datos disponibles sobre la fauna de concheros en la Bahía Babitonga, en relación con la presencia de cerámica en algunas de sus capas arqueológicas. Los resultados muestran algunas diferencias interesantes en los taxa y la cantidad de restos de animales entre las diferentes capas del mismo sitio y entre sitios. Discuto la diversidad cultural y la identidad de los habitantes prehistóricos que vivían en Bahía Babitonga, a la luz de una introducción relativamente tardía de la cerámica que afectó a menos del 10% de los conchales en la área.