Se presenta el análisis filogenético para 18 especies conocidas de Zeugmatothrips, usando el método del grupo externo. Cuando se incluyó al género Cyphothrips en el grupo interno, se obtuvieron novedosos resultados de un posible grupo no monofilético y nueve árboles con un c.i.= 0.594, h.i.=0.493, longitud=69 y un g=0.46 (p>0.01). El árbol de consenso estricto tiene un c.i. (Rohlf) =0.938. Las politomías se resolvieron utilizando el análisis de Dmáx (equiprobabilidad). Se repitió el análisis usando un ancestro hipotético, la longitud se incrementó pero el c.i. para el consenso fue similar