El propósito del presente estudio fue comprobar si han ocurrido cambios, después de 16 años, en los patrones de abundancia, distribución espacial y estructura de talla de la almeja de agua dulce Diplodon chilensis en sustratos arenosos y areno-pedregosos del sector Chauquén del Lago Panguipulli. Los resultados indican que las almejas en 1987 y 2003 presentan una distribución espacial agregada en ambos sustratos y con una mayor fuerza de la agregación en los sustratos areno-pedregosos que arenosos. La densidad fue significativamente mayor en sustrato areno-pedregoso, tanto en 1987 (P < 0,001) como en el 2003 (0,001< P < 0,01). No se presentaron diferencias significativas (P > 0,05) en densidad entre los distintos años dentro de un mismo tipo de sustrato. La estructura de talla en ambos sustratos y periodos estudiados no varió mayormente, registrándose sin embargo en 2003 juveniles en ambos sustratos, lo que indicaría que ha ocurrido reclutamiento. Se discuten estos resultados en relación al rol que desempeñan estos bivalvos en el ecosistema y en su potencial uso en la evaluación ecológica de ambientes lacustres.