Los ecotonos transicionales entre lagos y ríos han recibido menor atención que aquellos de ecosistemas terrestres, y pueden reunir características particulares de gran importancia para la conservación de la biodiversidad dulceacuícola. Con el objeto de evaluar lo anterior, se estudió la dinámica espacio-temporal de las abundancias y tallas, de poblaciones de 13 especies de peces nativos chilenos, presentes en la zona ecotonal Lago Riñihue - Río San Pedro, ubicada en la cuenca hidrográfica del río Valdivia (Chile). Se muestrearon mensualmente 35 sitios localizados en tres zonas hidromorfológicas del área de estudio (número de sitios por zona: Ml = 9, M2= 17, M3= 9). Los muestreos se llevaron a cabo el año 2006. De manera complementaria, se realizaron muestreos en todos los sitios los años 2007 (enero - febrero, junio - agosto y diciembre) y 2008 (enero - marzo). Los resultados de este estudio muestran la presencia de un ecotono muy dinámico tanto espacial como temporalmente, apoyando la hipótesis que estas zonas transicionales poseen características especiales que deben ser tomadas en consideración para la conservación de la biodiversidad.