Los peces nativos chilenos se caracterizan por ser de tamaño pequeño (<30 cm). Por ello, generalmente se les menciona como de baja capacidad de natación y desplazamiento. Sin embargo, no existen estudios empíricos que lo demuestren. En este estudio describimos los patrones de movimiento de seis especies nativas en el río San Pedro (Aplochiton taeniatus, Galaxias maculatus, Galaxias platei, Diplomystes camposensis, Basilichthys australis, Percilia gillissi y Percichthys trucha), utilizando técnicas de marcaje-recaptura mediante pinturas elastoméricas y Pit-tags. Nuestros resultados sugieren que la mayor parte de las especies presentan desplazamientos pasivos, recorriendo distancias de hasta aproximadamente 40 km en el sentido de la corriente. También fueron frecuentes los movimientos entre riberas, aún en zonas de alta turbulencia en el río. No se evidenciaron claros movimientos activos hacia aguas arriba, pero el análisis de los resultados en conjunto con información de la estructura genética, abundancias y distribución de las especies en la cuenca, nos permite concluir que los patrones de desplazamiento de todas las especies estudiadas son relevantes para la mantención de su dinámica metapoblacional.