O aumento da concentração dos gases de efeito estufa na atmosfera poderá ter conseqüências graves para toda sociedade. O desflorestamento e o uso dos solos para a produção de alimentos têm contribuído significativamente para aumentar a emissão desses gases. Com o objetivo de monitorar o teor de matéria orgânica e contabilizar o estoque de carbono de diversas unidades de solos, em área experimental de agricultura orgânica no estado do Espírito Santo, Brasil, foi realizado um estudo, caracterizando anualmente 12 unidades de solo, no período de 1990 a 2000. Observou-se acréscimo nos teores de matéria orgânica e de carbono do sistema. Na camada de 0 a 40 cm de profundidade, o estoque de carbono elevou-se de 34,57 t ha-1 para 58,19 t ha-1, com fixação de 23,62 t ha-1 em 10 anos, o que corresponde a 86,62 t ha-1 de CO2. Conclui-se que o manejo agroecológico em sistema orgânico de produção permite elevar o teor de matéria orgânica dos solos, pela reciclagem e seqüestro de carbono atmosférico, confirmando elevado potencial para reduzir as emissões de Gases de Efeito Estufa, podendo contribuir para a redução do aquecimento global.