Introducción: Los trastornos límite de personalidad se caracterizan por una elevada impulsividad y agresividad. Las conductas agresivas e impulsivas se han asociado a disfunciones del sistema serotoninérgico y responden a los inhibidores de la recaptura de serotonina (ISRS). En depresión mayor el alelo corto (S) del promotor del gene del transportador de serotonina se asocia a pobre respuesta a los ISRS. El objetivo de este trabajo es estudiar el efecto anti-impulsivo de serotonina y su relación con los alelos LyS en pacientes con trastorno límite de personalidad. Método: 59 pacientes con trastorno límite de personalidad fueron tratados por 12 semanas confluoxetina. Se evaluó la impulsividad mediante la Overt Aggression Scale Modified (OAS-M)yse determinó los polimorfismos LyS. Resultados: Los portadores de S (LS y SS) presentaron una menor reducción en la OAS-M total y en la subescala de agresividad que los homocigotos LL. Conclusiones: En trastorno límite de personalidad el alelo S del promotor del gene del transportador de serotonina predice pobre respuesta anti-impulsiva de lafluoxetina. Probablemente múltiples genes participen en la respuesta a los ISRS.