Introducción: Dado casos de hipotermia en recién nacidos (RN) posterior a resonancia magnética (RM) con anestesia y reproduciendo lo observado en centros extranjeros visitados, implementamos protocolo supervisado para evaluar los resultados de RM encefálicas realizadas sin anestesia o sedación en pacientes hospitalizados en nuestra institución. Objetivo: Mostrar resultados del protocolo para realización de RM encefálica sin anestesia en nuestros pacientes RN. Materiales y métodos: Estudio retrospectivo, evaluamos RM encefálicas realizadas en RN entre septiembre 2012 - julio 2013. Se aplicó protocolo para realización de RM sin anestesia en pacientes institucionalizados. Se comparan variables con RM realizadas con anestesia en ese periodo. Resultados: Se realizaron 22 RM encefálicas, 14 sin anestesia. La duración del estudio sin anestesia fue de 48 minutos promedio, obteniendo imágenes adecuadas en 13 estudios, reprogramando el examen con anestesia en un caso. Conclusiones: el protocolo implementado permite obtener RM encefálicas de calidad diagnóstica, obviando la anestesia.