La periodontitis constituye la infección bacteriana más prevalente a nivel mundial y representa un factor de riesgo para diversas patologías sistémicas. El estado de inflamación y destrucción periodontal se manifiestan a través de la presencia de biomarcadores en el suero y fluidos orales, tales como el fluido gingival crevicular (FGC), saliva y enjuague oral. Enzimas como las metaloproteinasas de matriz (MMP) y mieloperoxidasa, constituyen biomarcadores potenciales para ensayos moleculares complementarios a la clínica de uso en el sillón dental. A continuación se presenta una revisión de la literatura respecto de la aplicación potencial del análisis de metaloproteinasas de matriz extracelular (MMPs) en el diagnóstico complementario de las enfermedades periodontales. Se ha demostrado que los niveles de MMP-9, -13 y particularmente de MMP-8, se asocian con el grado de inflamación periodontal, y pueden diferenciar entre sujetos sanos, con gingivitis, periodontitis y peri-implantitis, mientras que la mejoría de los parámetros clínicos en respuesta al tratamiento periodontal se asocia con la reducción de la activación y niveles de estas enzimas en FGC, como así también en el suero. Se concluye que la determinación, particularmente de MMP-8 en fluidos orales presenta un elevado potencial como complemento de los métodos clínicos tradicionales para identificar a los pacientes con periodontitis o en riesgo de desarrollar la enfermedad, monitorear fases del tratamiento y mejoría de signos periodontales e incluso evaluar el estado de inflamación sistémica.