En el presente artículo se analiza la estructura del plan estratégico institucional y los planes sectoriales o de las unidades que conforman una universidad. La situación de la Universidad del Bio Bio, ubicada en Concepción (Chile) es tomada cono caso de estudio. A través de una metodología cualitativa y estructurada, tanto de aplicación del conocimiento de las temáticas, como participativa en la confección y retroalimentación de dichos planes, se evidencia que existen distintos estados de avances de estos procesos de planificación estratégica. Este desnivel de avance afecta la rapidez del logro del alineamiento sectorial al institucional. Para lograr el alineamiento de los planes de las distintas unidades (Facultades, Departamentos, Escuelas) al Plan de Desarrollo Corporativo se adoptó en forma exitosa un modelo propuesto por el estamento directivo de la universidad.