Background: Pregnant woman is exposed to many sexual transmitted infections (STI). Many of these infections may produce diseases in the fetus and newborn, and also alteration in the normal course of the pregnancy. Aim: Screening of asymptomatic cervical infection in pregnant woman and its relationship with the vaginal microbiota. Patients and Methods: 85 pregnant women without clinical cervicitis who consult in the routine pregnant control (47 patients) and women derived from STI service (38 patients). The samples were obtained from the vaginal fund sac and were analyzed with optic microscopy, cultures and PCR of Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis and Chlamydia trachomatis. Results: 12,9% of the enrolled women were positive for C. trachomatis, 2,4% for T. vaginalis. In this study, we did not found N. gonorrhoeae. We observed 23,3% of patients with altered microbiota (bacterial vaginosis and intermediate microbiota) was positive for C. trachomatis. Conclusions: In this study, we found a high frequency of C. trachomatis infection, that correlates with the presence of altered microbiota. This high frequency would promote preventive strategies in the pregnant women routine controls.Introducción: La mujer embarazada está expuesta a numerosas infecciones de transmisión sexual (ITS), las cuales pueden producir aborto, enfermedad en el feto y/o en el recién nacido, además de alteraciones en el curso normal del embarazo.Objetivo: Determinar la frecuencia de infección cervical en mujeres embarazadas y su relación con la microbiota.Pacientes y métodos: Se enrolaron 85 mujeres embarazadas sin cervicitis clínica que consultaron en control de rutina de embarazo y que fueron derivadas a una unidad de ITS. Se tomaron muestras de fondo de saco vaginal, que fueron analizadas por técnicas clásicas de microscopía y cultivo corriente y PCR para N. gonorrhoeae, T. vaginalis y C. trachomatis.Resultados: Se encontró un 12,9% de infección por Chlamydia trachomatis, un 2,4% de Trichomonas vaginalis. En este estudio no se encontró Neisseria gonorrhoeae. El 23,3% de pacientes con microbiota alterada (vaginosis bacteriana y microbiota intermedia) fue positiva para C. trachomatis.Conclusión: En este trabajo, encontramos una alta frecuencia de infección por C. trachomatis, que se relaciona en forma significativa con la presencia de microbiota alterada. Esta alta frecuencia debería promover estrategias preventivas en los controles de salud de la embarazada.