Severe sepsis and septic shock by Escherichia coli, clinical and microbiological analysis in Medellin, Colombia
Análisis clínico y microbiológico de la sepsis grave y el choque séptico por Escherichia coli en Medellín, Colombia
Author
Restrepo-Álvarez, Camilo A.
Bernal, Elisa
Ascuntar-Tello1, Johana
Jaimes, Fabián
Abstract
Background: Escherichia coli is a common cause of a broad spectrum of infections, from non-complicated urinary tract infection, to severe sepsis and septic shock, that are associated to high impact outcomes, such as ICU admission and mortality. Aims: To establish differences in mortality, ICU admission, ESBL positive strains and antibiotic treatment, between patients with E. coli related severe sepsis and septic shock, with or without bacteremia and its variability based on the source of infection. Method: Secondary data analysis of a multicentric prospective cohort study. Results: From 458 patients with E. coli isolation, 123 had E. coli exclusively in blood culture, 222 solely in urine culture, and 113 in both samples. Escherichia coli isolation exclusively in blood culture was associated with higher frequency of ICU admission (n = 63; 51.2%), higher rate of mechanical ventilation requirement (n = 19; 15.5%), higher mortality and longer hospital stay (n = 22; 18%; median of 12 days, IQR= 7 – 17, respectively); but with a lower occurrence of ESBL strains, compared to patients with positive urine culture and positive blood/urine cultures (n = 20; 17.7% and n = 46; 20.7%, respectively). 424 patients (92.6%) received antibiotic treatment in the first 24 hours. The most commonly prescribed was piperacilin/tazobactam (n = 256; 60.3%). The proportion of patients empirically treated with carbapenems vs non-carbapenems was similar in the three groups. Discussion: The source of infection, associated with ESBL strains risk factors, are useful tools to define prognosis and treatment in this population, because of their clinical and microbiological variability. Conclusion: Patients with E. coli isolation exclusively in the blood culture had higher frequency of non-favorable outcomes in comparison to patients with E. coli in urine culture with or without bacteremia. Additionally, in our population patients with E. coli solely in blood culture have lower prevalence of ESBL positive strains. Introducción: Escherichia coli es causa frecuente de un amplio espectro de infecciones, desde una infección urinaria no complicada hasta la sepsis grave y el choque séptico, asociadas con desenlaces de alto impacto como ingreso a UCI y mortalidad. Objetivos: Determinar las diferencias en mortalidad, ingreso a UCI/UCE, presencia de cepas BLEE y tratamiento antimicrobiano en pacientes con sepsis grave y choque séptico por E. coli, con o sin bacteriemia, así como su variabilidad dependiendo del foco infeccioso. Material y Métodos: Análisis secundario de estudio de cohorte prospectivo multicéntrico. Resultados: De 458 pacientes que tenían infección por E. coli, 123 tenían aislamiento sólo en hemocultivo, 222 sólo en urocultivo y 113 en ambas muestras. El aislamiento sólo en hemocultivo se asoció mayor frecuencia de ingreso a UCI (n = 63; 5,2%), mayor necesidad de ventilación mecánica (n = 19; 15,5%), mayor mortalidad y estancia hospitalaria (n = 22; 18%; mediana de 12 días, RIQ= 7-17, respectivamente), pero con menor presencia de cepas productoras de BLEE en comparación con urocultivos y hemocultivo/urocultivo (n = 20; 17,7% y n = 46; 20,7%, respectivamente). Recibieron tratamiento antimicrobiano en las primeras 24 h 424 pacientes (92,6%), con más frecuencia piperacilina/ tazobactam (n = 256, 60,3%). La proporción de pacientes tratados empíricamente con carbapenémicos vs no carbapenémicos fue similar en los tres grupos. Discusión: El foco infeccioso, sumado a factores de riesgo para cepas productoras de BLEE, son herramientas útiles para definir pronóstico y tratamiento en esta población, debido a la variabilidad clínica y microbiológica en los distintos aislados. Conclusión: Los pacientes con aislamiento de E. coli sólo en hemocultivo presentan con mayor frecuencia desenlaces desfavorables en comparación con los pacientes con E. coli en urocultivo, con o sin bacteriemia. Llama la atención en nuestro medio la menor cantidad de cepas productoras de BLEE en los pacientes con sólo hemocultivo positivo.