Molecular characterization and detection of genes blaCTX-M groups 1 and 9 in Klebsiella pneumoniae resistant to ceftazidime, in a hospital in San José de Cúcuta, Colombia
Caracterización molecular y detección de genes blaCTX-M grupos 1 y 9 en Klebsiella pneumoniae resistentes a ceftazidima, en un hospital de San José de Cúcuta, Colombia
dc.contributor | en-US | |
dc.contributor | Universidad de Santander y Universidad Francisco de Paula Santander | es-ES |
dc.creator | Galvis Serrano, Fabian | |
dc.creator | Moreno R., Laura | |
dc.date | 2019-06-28 | |
dc.date.accessioned | 2019-09-11T13:36:55Z | |
dc.date.available | 2019-09-11T13:36:55Z | |
dc.identifier | http://revinf.cl/index.php/revinf/article/view/110 | |
dc.identifier.uri | https://revistaschilenas.uchile.cl/handle/2250/109032 | |
dc.description | Background: The expression of CTX-M β-lactamases belonging to groups 1 and 9 in Klebsiella pneumoniae produces high levels of resistance to ceftazidime, and they have a wide distribution worldwide. Aim: To identify and characterize the blaCTX-M-Group1 and blaCTX-M-Group9 genes in K. pneumoniae isolates resistant to ceftazidime in a hospital in San José de Cúcuta, Colombia. Material and Methods: Primers were designed for the identification of K. pneumoniae and blaCTX-M genes by PCR. Subsequently, the genetic relationship of these isolates was analyzed by REP-PCR. Results: A 38% of the 24 isolates identified by PCR as K. pneumoniae showed blaCTX-M-3. blaCTX-M-15 y blaCTX-M-32 genes (Group CTX-M-1) and 42% blaCTX-M14. blaCTX-M-24 y blaCTX-M-27 genes (Group CTX-M-9). The phylogenetic analysis grouped the K. pneumoniae isolates into 4 clusters, showing correlation in clusters I, II and IV, when comparing the genetic profiles with the type of sample and group of genes. Discussion: We found a similar frequency of blaCTX-M-Group 1 and blaCTX-M-Group 9 genes in isolates of K. pneumoniae resistant to ceftazidime. The correlation between the REP-PCR with the CTX-M groups and the type of sample revealed the presence of three clonal patterns. | en-US |
dc.description | Introducción. La expresión de β-lactamasas CTX-M pertenecientes a los grupos 1 y 9 en Klebsiella pneumoniae produce niveles altos de resistencia a ceftazidima, y presentan una amplia distribución a nivel mundial.Objetivo. Identificar y caracterizar los genes blaCTX-M-Grupo1 y blaCTX-M-Grupo9 en aislados de K. pneumoniae resistentes a ceftazidima en un hospital de San José de Cúcuta, Colombia.Material y Métodos. Se diseñaron cebadores para la identificación de K. pneumoniae y los genes blaCTX-M mediante PCR. Posteriormente se realizó el análisis de la relación genética de estos aislados por medio de la repPCR.Resultados. Los 24 aislados identificados por PCR como K. pneumoniae presentaron un 38% de genes blaCTX-M-3. blaCTX-M-15y blaCTX-M-32(Grupo CTX-M-1) y un 42% de genes blaCTX-M14. blaCTX-M-24y blaCTX-M-27 (Grupo CTX-M-9). El análisis filogenético agrupó los aislados de K. pneumoniae en 4 clusters, mostrando correlacion en los clusters I, II y IV, al comparar los perfiles genéticos con el tipo de muestra y grupo de genes.Discusión. Se presenta el primer reporte en la región Norooriental de Colombia, evidenciando una frecuencia similar de los genes blaCTX-M-Grupo1 y blaCTX-M-Grupo9 en 19 aislados de K. pneumoniae resistentes a ceftazidima. La correlación entre la repPCR con los grupos de CTX-M y el tipo de muestra reveló la presencia de tres patrones clonales involucrando 12 aislados. | es-ES |
dc.format | application/pdf | |
dc.language | spa | |
dc.publisher | Sociedad Chilena de Infectología | es-ES |
dc.relation | http://revinf.cl/index.php/revinf/article/view/110/196 | |
dc.rights | Copyright (c) 2019 Revista Chilena de Infectología | es-ES |
dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0 | es-ES |
dc.source | Revista Chilena de Infectología; Vol. 36, Núm. 3 (2019): Junio | es-ES |
dc.source | 0717-6341 | |
dc.source | 0716-1018 | |
dc.subject | en-US | |
dc.subject | blaCTX-M; ceftazidime; Klebsiella pneumoniae | en-US |
dc.subject | Microbiologìa | es-ES |
dc.subject | blaCTX-M; ceftazidima; Klebsiella pneumoniae | es-ES |
dc.title | Molecular characterization and detection of genes blaCTX-M groups 1 and 9 in Klebsiella pneumoniae resistant to ceftazidime, in a hospital in San José de Cúcuta, Colombia | en-US |
dc.title | Caracterización molecular y detección de genes blaCTX-M grupos 1 y 9 en Klebsiella pneumoniae resistentes a ceftazidima, en un hospital de San José de Cúcuta, Colombia | es-ES |
dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | |
dc.type | es-ES | |
dc.type | es-ES | |
dc.type | en-US |
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Revista Chilena de Infectología
[0-9]{4}